無論是高新技術企業(yè)認定，還是IPO上市審核，研發(fā)費用都是審核的重點，企業(yè)會計賬面核算的研發(fā)費用、所得稅申報的加計扣除研發(fā)費用、高新技術企業(yè)認定申報的研發(fā)費用，三者歸集的口徑大致相同，但也存在差異，審核機構(gòu)在看到差異時往往會要求企業(yè)披露差異原因，從不同的口徑驗證研發(fā)費用的真實性和歸集的準確性。本文將結(jié)合具體實例，探討研發(fā)費用差異說明如何闡述。
案例1: 某真空科技股份有限公司
首輪審核問詢問題：
關于管理費用和研發(fā)費用，申報文件顯示報告期內(nèi)發(fā)行人研發(fā)費用以人工費用、直接材料費用為主請發(fā)行人: 說明研發(fā)費用賬面金額與研發(fā)費用加計扣除基數(shù)的差異。
差異說明回復:
公司向稅務機關申請研發(fā)費用加計扣除優(yōu)惠政策的研發(fā)費用金額小于實際發(fā)生的研發(fā)費用金額，主要原因如下：
1、公司不符合研發(fā)費用加計扣除范圍的其他費用主要為研發(fā)相關的辦公費、差旅費、租金及管理費等，該類費用不符合《財政部、國家稅務總局、科技部關于完善研究開發(fā)費用稅前加計扣除政策的通知》 (財稅[2015] 119 號)、《關于提高研究開發(fā)費用稅前加計扣除比例的通知》 (財稅[2018] 99號)等相關文件的規(guī)范要求，公司在計算加計扣除的研發(fā)費用時進行了扣減。
2、公司委托外部機構(gòu)或個人開展研發(fā)活動發(fā)生的費用，加計扣除時按照研發(fā)活動發(fā)生費用的80%作為加計扣除基數(shù)，對于不符合加計扣除范圍的技術服務費未在納稅申報時進行加計扣除。
3、不符合研發(fā)費用加計扣除范圍的折舊與攤銷主要是研發(fā)實驗室裝修費的攤銷、使用權(quán)資產(chǎn)折舊費，未在公司納稅申報時進行加計扣除。
案例2： 某科技股份有限公司
首輪審核問詢問題：
關于研發(fā)費用，根據(jù)申報文件， (1) 公司研發(fā)費用分別為 3,020.05 萬元、3,251.68 萬元及4082.75 萬元，占營業(yè)收入的比例分別為 24.88%、27.42%及 21.64%，可比公司分別為17.23%、18.15%和19.77%; (2)研發(fā)費用中，職工薪酬占比分別為 74.55%、77.86%和 82.90%，逐年增加。請企業(yè)說明報告期各期研發(fā)費用與申請研發(fā)費用加計扣除時所用研發(fā)費用的差異情況及原因。
差異說明回復:
報告期內(nèi)，公司各年研發(fā)費用的發(fā)生額與每年匯算清繳時加計扣除的研發(fā)費用金額之間存在差異，研發(fā)費用與加計扣除數(shù)之間的差異情況具體如下：
公司根據(jù)《企業(yè)會計準則》《研發(fā)投入核算管理制度》等相關規(guī)定制定了完善的研發(fā)管理制度，明確研發(fā)費用的歸集范圍及核算程序，確保研發(fā)費用歸集及核算的準確性。存在部分未加計扣除的情況，具體差異原因如下:
1、2020年度公司之子公司虧損較多，未產(chǎn)生企業(yè)所得稅納稅義務，全額申報研發(fā)費用加計扣除對子公司生產(chǎn)經(jīng)營及稅收優(yōu)惠影響較小，因此未申請研發(fā)費用的加計扣除。
2、2018 年研發(fā)人員獎金及部分研發(fā)人員薪酬。2018 年計算年終獎較晚，在匯算清繳前未能整理出加計扣除的相關資料，故此部分未申報研發(fā)加計扣除。2018 年部分研發(fā)人員的薪酬未分配在研發(fā)項目上，故此部分未申報研發(fā)加計扣除。
3、未申請加計扣除項目費用。公司與政府合作的科研項目，出于謹慎性原則，對于享受政府補助部分未申請加計扣除。
4、委外研發(fā)費用。委外研發(fā)費主要系公司委托企業(yè)對指定項目的技術開發(fā)，與高校開展聯(lián)合實驗室等費用，項目研發(fā)人員全部為企業(yè)、高校的員工，且公司并未單獨立項并投入其他研發(fā)資源，從謹慎性出發(fā)，公司未申請加計扣除。
5、租賃費。租賃費用不屬于加計扣除允許扣除的項目，因此公司未申請加計扣除。
6、資產(chǎn)折舊及長期待攤費用攤銷。2019年部分資產(chǎn)折舊分配錯誤，因金額較小，未重新申報研發(fā)費用加計扣除金額。2020 年未申報研發(fā)費用加計扣除的金額為長期待攤費用攤銷，系裝修費攤銷，因無法在各個研發(fā)項目之間進行準確劃分，出于稅務謹慎性原則，公司在申報研發(fā)費用加計扣除時對此類費用予以減除。
7、其他費用系零星工具費用報銷，因無法在各個研發(fā)項目之間進行準確劃分，出于稅務謹慎性原則，公司在申報研發(fā)費用加計扣除時對此類費用予以減除。
高企認定審核部門通常會通過對各口徑歸集的研發(fā)費用進行比較，以驗證研發(fā)費用的真實性和歸集的準確性，如果企業(yè)在這方面存在較大差異，必定會引起審核部門的注意。因此，存在這種情況的企業(yè)應關注差異產(chǎn)生的原因，做出合理的解釋。
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