美國科學(xué)院理事會是科學(xué)院的最高管理機(jī)構(gòu)，下設(shè)多個職能部門，包括：
科學(xué)院理事會。由科學(xué)院的公職人員與其他12名院士組成，是科學(xué)院內(nèi)最高管理機(jī)關(guān)，負(fù)責(zé)制定各種決議文件和監(jiān)管其他部門的重要事務(wù)，以及其他科學(xué)院相關(guān)事務(wù)。
執(zhí)行委員會。由科學(xué)院院長、副院長、內(nèi)務(wù)秘書、財務(wù)主管和另外3人的7名成員組成執(zhí)行委員會，科學(xué)院院長與內(nèi)務(wù)秘書分別任執(zhí)行委員會主席與秘書。
財務(wù)委員會。財務(wù)委員會由科學(xué)院財務(wù)主管、院長以及院長指定的不超過6名的院士組成，負(fù)責(zé)科學(xué)院所有財務(wù)資源的管理和相關(guān)事務(wù)。
國家研究理事會。理事會的管理委員會成員包括：科學(xué)院院長、副院長、財務(wù)主管和3名科學(xué)院理事會的成員；工程院院長和4名工程院理事會的成員；醫(yī)學(xué)院院長和1名醫(yī)學(xué)院理事會的成員。理事會的執(zhí)行委員會成員包括：科學(xué)院院長和2名科學(xué)院理事會的成員；工程院院長和1名工程院理事會的成員；醫(yī)學(xué)院院長。
公職人員。美國科學(xué)院的公職人員有院長、副院長、內(nèi)務(wù)秘書、外事秘書和財務(wù)主管各1名。
美國科學(xué)院按專業(yè)領(lǐng)域設(shè)有6個學(xué)團(tuán)：物理學(xué)與數(shù)學(xué)、生命科學(xué)、工程與應(yīng)用數(shù)學(xué)及物理學(xué)、醫(yī)學(xué)、行為學(xué)與社會學(xué)、應(yīng)用生物學(xué)與農(nóng)業(yè)科學(xué)。然后在每一學(xué)團(tuán)內(nèi)再根據(jù)院士專業(yè)劃分學(xué)部?，F(xiàn)在共有31個學(xué)部。
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